Wiss. Mitarbeiter*in (Praedoc) (w/m/d) / Research assistant (praedoc) (f/m/d)
Das sind wir
Die Arbeitsgruppe Algorithmische Bioinformatik von Prof. Dr. Ing. Knut Reinert beschäftigt sich mit der Entwicklung neuer Algorithmen und Datenstrukturen für Probleme bei der Analyse biomedizinischer Massendaten. In diesem Zusammenhang liegt ein Schwerpunkt der Forschung auf der Entwicklung effizienter Datenstrukturen. Weitere Informationen zu der Forschung und den Aufgaben der AG Algorithmische Bioinformatik finden Sie unter dem Link http://www.mi.fu-berlin.de/en/inf/groups/abi/.
Das erwartet Sie bei uns
Wir suchen eine:n wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in für das DFG-Projekt RegExBis. Das Projekt ist eine Kollaboration mit der HU Berlin und dem Technion Haifa. Die Stelle beschäftigt sich mit der Entwicklung k-mer basierter Filter für die effiziente Datenbanksuche von Instanzen regulärer Ausdrücke und sinnvoller Erweiterungen (z.B. Distanzbeschränkungen) derselben. Kern wird die Anfrage von bioinformatischen Ausdrücken sein, d.h. für das Filtern in Genom- und Proteindatenbanken.
Das bringen Sie mit
Abgeschlossenes wiss. Hochschulstudium (MSc) in Bioinformatik, Informatik oder vergleichbar.
Das wünschen wir uns von Ihnen
- Wenn möglich, bereits Vorbeschäftigungen ähnlicher Art
- Erfahrung mit Programmierung in der SeqAn Bibliothek
- Sichere Kenntnisse in C++ und generischer Programmierung
- Kenntnisse in Parallelprogrammierung und Vektorisierung
- Erfahrung im Erstellen einer Software-Dokumentation
- Vertrautheit mit Next Generation Sequencing (NGS) Problemen und Daten
- Vertrautheit mit der HIBF Datenstruktur
- Gender- und Diversitykompetenz
Unser Angebot/ Ihre Benefits
- Flexible Arbeitszeiten und mobiles Arbeiten nach Absprache, sofern möglich
- 30 Tage Urlaub bei einer 5-Tage-Woche
- Arbeitsfreie Tage am 24.12. und 31.12.
Haben wir Ihr Interesse geweckt?
Dann freuen wir uns auf Ihre aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen. Bitte senden Sie uns Ihre Bewerbung ausschließlich über unser Karriereportal, indem Sie auf den Button „Jetzt bewerben“ klicken. Bewerbungen in Papierform oder per E-Mail können leider nicht berücksichtigt werden.
Weitere Informationen zum Stellenprofil erteilt Prof. Knut Reinert (knut.reinert@fu-berlin.de).